Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms