Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms