Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF550Q7Z398 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF550Q7Z398 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF550Q7Z398 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF550Q7Z398 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF550Q7Z398 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms