Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ScocQ78YZ6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ScocQ78YZ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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