Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC80Q76M96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms