Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BBS12Q6ZW61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms