Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCARA5Q6ZMJ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA5Q6ZMJ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA5Q6ZMJ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms