Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD4Q6W3E5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms