Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LCLAT1Q6UWP7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCLAT1Q6UWP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms