Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPPQ6IPU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPPQ6IPU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms