Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CARMIL2Q6F5E8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CARMIL2Q6F5E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms