Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX8Q68G74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX8Q68G74 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms