Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOCADQ5VW36 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOCADQ5VW36 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms