Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf53Q5VUE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms