Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1LQ5PSV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms