Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF394Q53GI3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF394Q53GI3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms