Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2CQ496J9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms