Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNXAQ16473 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TNXAQ16473 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNXAQ16473 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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