Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNA2Q15822 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNA2Q15822 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms