Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC23BQ15437 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms