Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSPNQ14714 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms