Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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IRF3Q14653 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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IRF3Q14653 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF3Q14653 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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