Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME3Q13232 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME3Q13232 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME3Q13232 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME3Q13232 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME3Q13232 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME3Q13232 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME3Q13232 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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