Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RESTQ13127 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RESTQ13127 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RESTQ13127 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RESTQ13127 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RESTQ13127 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RESTQ13127 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RESTQ13127 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RESTQ13127 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RESTQ13127 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RESTQ13127 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RESTQ13127 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms