Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF2Q12933 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF2Q12933 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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