Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFSWAPQ12872 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFSWAPQ12872 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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