Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 ARL3YPL051W 597 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 NPL4YBR170C 1743 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 ENT1YDL161W 1365 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 NUF2YOL069W 1356 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 KEX1YGL203C 2190 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PGM2YMR105C 1710 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PXR1YGR280C 816 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 LSO1YJR005C-A 282 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLR462WYLR462W 609 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNL171CYNL171C 369 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNL181WYNL181W 1224 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNR061CYNR061C 660 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YBR013CYBR013C 390 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPR153WYPR153W 423 nt5.01□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 FRT2YAL028W 1587 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 THI20YOL055C 1656 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 GPM2YDL021W 936 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 SPO11YHL022C 1197 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MDM12YOL009C 816 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 IZH4YOL101C 939 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MRP2YPR166C 348 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPR174CYPR174C 666 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 GPB1YOR371C 2694 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 STB3YDR169C 1542 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 SSU1YPL092W 1377 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 APM3YBR288C 1452 nt5□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 SRO9YCL037C 1305 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 CDC9YDL164C 2268 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PEX29YDR479C 1665 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YDL186WYDL186W 834 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 DET1YDR051C 1005 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 RAD55YDR076W 1221 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 VMA22YHR060W 546 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 JLP1YLL057C 1239 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 RFU1YLR073C 603 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLR202CYLR202C 327 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 GSP1YLR293C 660 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 EAF7YNL136W 1278 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PNO1YOR145C 825 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 DCS2YOR173W 1062 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YOR379CYOR379C 339 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPL068CYPL068C 882 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YPR027CYPR027C 834 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 ARO4YBR249C 1113 nt4.99□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MET12YPL023C 1974 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 DBP5YOR046C 1449 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YMR1YJR110W 2067 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MMT1YMR177W 1533 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 LPP1YDR503C 825 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 SRB5YGR104C 924 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 GTT1YIR038C 705 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YUH1YJR099W 711 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 AAD10YJR155W 867 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PML39YML107C 1005 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 CUZ1YNL155W 825 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 UFE1YOR075W 1041 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 SPP381YBR152W 876 nt4.98□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 FMP30YPL103C 1407 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 LYP1YNL268W 1836 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 VID22YLR373C 2706 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 EUG1YDR518W 1554 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLR108CYLR108C 1458 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MSS2YDL107W 1056 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 MRPS35YGR165W 1038 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 IRC25YLR021W 540 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 IBD2YNL164C 1056 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNR025CYNR025C 360 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 RPB8YOR224C 441 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 PNT1YOR266W 1272 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 NCE102YPR149W 522 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 GDH2YDL215C 3279 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 ALG11YNL048W 1647 nt4.97□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 HSP82YPL240C 2130 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 MEK1YOR351C 1494 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 MPS3YJL019W 2049 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 TYR1YBR166C 1359 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 AZR1YGR224W 1842 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YDR029WYDR029W 315 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YGL177WYGL177W 348 nt4.96□□□□□ -1.62
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