Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 IMH1YLR309C 2736 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SRO7YPR032W 3102 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 ERG5YMR015C 1617 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 MYO3YKL129C 3819 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 RPB2YOR151C 3675 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 NTH1YDR001C 2256 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 TRM13YOL125W 1431 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 VPS36YLR417W 1701 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 NPL4YBR170C 1743 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 CWC2YDL209C 1020 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 COS12YGL263W 1143 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 HIS6YIL020C 786 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 VPS71YML041C 843 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 VID27YNL212W 2349 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 FAR8YMR029C 1572 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 NOG1YPL093W 1944 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 ABP140YOR239W 1887 nt3.28□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YKL050CYKL050C 2769 nt3.28□□□□□ -1.89
USB1Q12208 BUD6YLR319C 2367 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 SIR2YDL042C 1689 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YCL075WYCL075W 441 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YHB1YGR234W 1200 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 BAT2YJR148W 1131 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YPL088WYPL088W 1029 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CKS1YBR135W 453 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 MLH2YLR035C 2088 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 FAT1YBR041W 2010 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CTR86YCR054C 1692 nt3.27□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YLR177WYLR177W 1887 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 MTC4YBR255W 2085 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 SMP3YOR149C 1551 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 PMT6YGR199W 2280 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 SMI1YGR229C 1518 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 MSW1YDR268W 1140 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 FUR1YHR128W 651 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 BUD27YFL023W 2391 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 KAP95YLR347C 2586 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CNA1YLR433C 1662 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 PWP2YCR057C 2772 nt3.26□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YBR138CYBR138C 1575 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YGL140CYGL140C 3660 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 HOM2YDR158W 1098 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YGR015CYGR015C 987 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YHR173CYHR173C 339 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 REH1YLR387C 1299 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 GAC1YOR178C 2382 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 NRP1YDL167C 2160 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YTM1YOR272W 1383 nt3.25□□□□□ -1.89
USB1Q12208 URA2YJL130C 6645 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 PPQ1YPL179W 1650 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 WHI4YDL224C 1950 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 RAI1YGL246C 1164 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YGR139WYGR139W 339 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 IGO2YHR132W-A 396 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YKR047WYKR047W 306 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CDC73YLR418C 1182 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 GLO4YOR040W 858 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 PEX1YKL197C 3132 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 VPS27YNR006W 1869 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 ARO1YDR127W 4767 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 HEF3YNL014W 3135 nt3.24□□□□□ -1.89
USB1Q12208 AIP1YMR092C 1848 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CNN1YFR046C 1086 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 TIM21YGR033C 720 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YGR051CYGR051C 324 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 MRPL24YMR193W 777 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 ASI2YNL159C 870 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 IST1YNL265C 897 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YNR071CYNR071C 1029 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 DDP1YOR163W 567 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 SSL1YLR005W 1386 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 TYR1YBR166C 1359 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 CAF130YGR134W 3369 nt3.23□□□□□ -1.89
USB1Q12208 UTP25YIL091C 2166 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 IMD4YML056C 1575 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 ROD1YOR018W 2514 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 YEL028WYEL028W 462 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 FLD1YLR404W 858 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 COQ5YML110C 924 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 PEX12YMR026C 1200 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 RSF1YMR030W 1131 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 MCM1YMR043W 861 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 SSU1YPL092W 1377 nt3.22□□□□□ -1.89
USB1Q12208 ORC4YPR162C 1590 nt3.21□□□□□ -1.89
USB1Q12208 IES6YEL044W 501 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 YEL074WYEL074W 339 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 RPS0AYGR214W 759 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 MRS3YJL133W 945 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 AUR1YKL004W 1206 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 JLP1YLL057C 1239 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 HTA2YBL003C 399 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 RUF21RUF21 707 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 RAD17YOR368W 1206 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 STU1YBL034C 4542 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 SUC2YIL162W 1599 nt3.21□□□□□ -1.9
USB1Q12208 RPN2YIL075C 2838 nt3.2□□□□□ -1.9
USB1Q12208 ETP1YHL010C 1758 nt3.2□□□□□ -1.9
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