Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YER119C-AYER119C-A 372 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 DPH5YLR172C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YMR130WYMR130W 909 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 LST8YNL006W 912 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YNL109WYNL109W 546 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 CIN5YOR028C 888 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YPL225WYPL225W 441 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 LCB2YDR062W 1686 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 TRM12YML005W 1389 nt6.67□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 NOG2YNR053C 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 UGA2YBR006W 1494 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 PPM2YOL141W 2088 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 GPD1YDL022W 1176 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YDR149CYDR149C 708 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 LCL3YGL085W 825 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 ARC18YLR370C 537 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YMR254CYMR254C 309 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 MCM16YPR046W 546 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YLL066CYLL066C 3618 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YEL023CYEL023C 2049 nt6.66□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 RSC2YLR357W 2670 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 ALG6YOR002W 1635 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 PHR1YOR386W 1698 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 CDC34YDR054C 888 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 MET32YDR253C 576 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YDR391CYDR391C 699 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YER107W-AYER107W-A 321 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YGR025WYGR025W 303 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 LRP1YHR081W 555 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 YIL029CYIL029C 429 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 DFG10YIL049W 762 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 IMP2YMR035W 534 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 RRT16YNL105W 429 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 DFR1YOR236W 636 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 ARL1YBR164C 552 nt6.65□□□□□ -1.34
BUD20Q08004 RPT1YKL145W 1404 nt6.65□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 UBC13YDR092W 462 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 QCR8YJL166W 285 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MRPL10YNL284C 969 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 RPL5YPL131W 894 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YRB30YGL164C 1323 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 APN2YBL019W 1563 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YML020WYML020W 1995 nt6.64□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 JIP4YDR475C 2631 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 ASF1YJL115W 840 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 TAL1YLR354C 1008 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MRP21YBL090W 534 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MSS18YPR134W 807 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 RPL19AYBR084C-A 570 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YCL012CYCL012C 405 nt6.63□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 snR65snR65 100 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YEL057CYEL057C 702 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 GET1YGL020C 708 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 HEM2YGL040C 1029 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 TOS6YNL300W 309 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 RQC1YDR333C 2172 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 GEX1YCL073C 1848 nt6.62□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 PDH1YPR002W 1551 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 CMK2YOL016C 1344 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 STF1YDL130W-A 261 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 SWF1YDR126W 1011 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 VMA8YEL051W 771 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MAG1YER142C 891 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 GCD14YJL125C 1152 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 GCN3YKR026C 918 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 YLR317WYLR317W 435 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 RIO2YNL207W 1278 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 OST2YOR103C 393 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 IXR1YKL032C 1794 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 NSE5YML023C 1671 nt6.61□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 LYS21YDL131W 1323 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 URA7YBL039C 1740 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 BNA7YDR428C 786 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 GUK1YDR454C 564 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 PRM8YGL053W 714 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 SLX9YGR081C 633 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 CAP2YIL034C 864 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 ATG36YJL185C 882 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MET14YKL001C 609 nt6.6□□□□□ -1.35
BUD20Q08004 MDG1YNL173C 1101 nt6.6□□□□□ -1.35
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