Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN1Q04323 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN1Q04323 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms