Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN7AQ01118 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN7AQ01118 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms