Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IRF9Q00978 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF9Q00978 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF9Q00978 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms