Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gbp10Q000W5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp10Q000W5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp10Q000W5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms