Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMF1P82094 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMF1P82094 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMF1P82094 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMF1P82094 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TMF1P82094 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMF1P82094 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMF1P82094 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMF1P82094 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMF1P82094 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMF1P82094 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMF1P82094 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMF1P82094 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMF1P82094 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMF1P82094 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMF1P82094 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMF1P82094 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMF1P82094 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMF1P82094 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMF1P82094 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TMF1P82094 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TMF1P82094 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMF1P82094 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMF1P82094 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMF1P82094 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMF1P82094 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms