Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ufd1P70362 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ufd1P70362 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms