Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abce1P61222 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abce1P61222 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abce1P61222 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Abce1P61222 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms