Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNAP25P60880 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNAP25P60880 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNAP25P60880 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms