Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCBP4P57723 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCBP4P57723 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCBP4P57723 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCBP4P57723 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms