Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2BFSP57053 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2BFSP57053 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms