Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AIF1P55008 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AIF1P55008 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AIF1P55008 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AIF1P55008 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AIF1P55008 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AIF1P55008 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AIF1P55008 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AIF1P55008 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AIF1P55008 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AIF1P55008 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AIF1P55008 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms