Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HIRAP54198 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HIRAP54198 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HIRAP54198 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HIRAP54198 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HIRAP54198 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HIRAP54198 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HIRAP54198 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HIRAP54198 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HIRAP54198 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRAP54198 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRAP54198 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HIRAP54198 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms