Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A3P53794 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms