Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbx2P48031 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbx2P48031 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms