Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC4P43686 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC4P43686 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms