Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK1P29120 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms