Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF8P28908 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms