Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNNA2P26232 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNA2P26232 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNA2P26232 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms