Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGFR3P22607 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGFR3P22607 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms