Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a2P20490 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a2P20490 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a2P20490 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms