Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA1P17302 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA1P17302 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA1P17302 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA1P17302 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA1P17302 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA1P17302 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms